《星际迷航:深空九号》(简称《DS9》)是《星际迷航》系列的第三代，从1993年到1999年播出了七季，获得了三项艾美奖奖、九项其他奖项和42项提名。它不以“星舰企业号”及其船员为中心，主要描述围绕空间站“深空九号”的事件。故事发生在2369年。深空9号空间站最初是卡达西人占领北九后建造的采矿空间站(原名“Teroknor”)。直到资源全部被卡达西掏空，卡达西离开了采矿站，北九人因资源匮乏无法重建家园，只好向星际联邦求助。该空间站由星际联邦和Bekuyt共同管理，并更名为“深空9号”，因此成为联邦中最偏远的空间站。在第一集中，空间站附近发现了一个稳定的虫洞，可以快速往返于遥远的伽马象限。这一发现瞬间让这个空间站成为星际联邦中最有价值的空间站，也成为了进入这一片广阔的未开发空间的重要商业中心和军事中心。
虽然电视指南认为《深空九号》是性能、剪辑、制作和整体上最好的星舰系列，但很多传统星舰迷一开始并不能完全接受。有人说它已经抛弃了最初的星舰创造者让·罗登伯里的最初想法，但据报道，罗登伯里在去世前就认可了这个系列的概念。《DS9》颠覆了之前《星际迷航》系列对未来世界过于理想化的描述。它由一个废弃的采矿站和默契度很差的成员组成。而且由于深空九号站的地理位置和特殊外交，站长必须偶尔无视或违背星际联邦的“最高指导原则”，在这些诸多不完善的条件下，发展新的风格和管理方式。《DS9》中描绘的星舰时空，是银河系中大国之间的强权政治时代。基本上，《DS9》侧重于讨论战争、宗教、政治妥协等现代问题，人性的许多阴暗面都会在剧中展现。但是，对于外来种族的持续侵略，为了保护联邦的无辜公民，星际联邦不得不让战争发生在边境。这场战争持续了四年，《DS9》后期的剧情就是根据。