在本片的故事中，久经磨难的九头蛇海教集团想要夺取无敌浩克的伽马能量来颠覆世界，于是收买了浩克的宿敌恶灵，将浩克囚禁在发电厂中吸收他的能量。出乎意料的是，伽马能量如此强大，以至于它意外地创造了一个具有纯能量的怪物——沙克斯，而且根本没有人能控制他。另一方面，钢铁侠托尼·史塔克也探测到伽马能量的异常释放并前来调查，却被沙克斯、他的空中堡垒和钢铁军团控制。面对如此艰难的困境，钢铁侠和绿巨人只有联手才有机会翻盘。他们如何齐心协力打败强敌？